Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C3orf33Q6P1S2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C3orf33Q6P1S2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms