Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms