Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE12Q6L8Q7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE12Q6L8Q7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms