Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT80Q6KB66 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms