Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALS2CLQ60I27 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms