Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
C9orf84Q5VXU9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
C9orf84Q5VXU9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms