Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD13Q5VXD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD13Q5VXD3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms