Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf146Q5VVC0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf146Q5VVC0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms