Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
EFCAB2Q5VUJ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB2Q5VUJ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms