Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
OBSCNQ5VST9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms