Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPANXN1Q5VSR9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms