Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT6Q5T7P8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYT6Q5T7P8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms