Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC122Q5T0U0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms