Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf220Q5T0J3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms