Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NHSL1Q5SYE7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NHSL1Q5SYE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms