Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF14Q5SWL7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF14Q5SWL7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms