Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX1Q5SQQ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms