Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAT1Q5SQI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAT1Q5SQI0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms