Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC158Q5M9N0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms