Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1Q5M775 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms