Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC27A3Q5K4L6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms