Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPB2Q5JXA9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms