Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCID2Q5JVF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCID2Q5JVF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms