Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FGD3Q5JSP0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms