Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF542PQ5EBM4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF542PQ5EBM4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms