Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC3H12AQ5D1E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms