Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC178Q5BJE1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC178Q5BJE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms