Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF6Q58WW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF6Q58WW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms