Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms