Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms