Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ53S08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms