Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39Q53RE8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39Q53RE8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms