Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC92Q53HC0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC92Q53HC0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms