Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL12Q53G59 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms