Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFTN2Q52LD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN2Q52LD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms