Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC38Q502W7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms