Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM259Q4ZIN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms