Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A4Q4VNC1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A4Q4VNC1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A4Q4VNC1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms