Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM30BQ3MIR4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM30BQ3MIR4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms