Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A9Q2M3M2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms