Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSPP1Q1MSJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms