Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMPG1Q17R60 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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