Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST2H2ACQ16777 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST2H2ACQ16777 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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