Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HLFQ16534 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HLFQ16534 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HLFQ16534 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLFQ16534 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HLFQ16534 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HLFQ16534 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HLFQ16534 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HLFQ16534 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HLFQ16534 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLFQ16534 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLFQ16534 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLFQ16534 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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