Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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