Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP2Q16527 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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