Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY1Q16526 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms