Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASIC2Q16515 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC2Q16515 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms