Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNXAQ16473 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms