Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA6Q15825 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA6Q15825 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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